网站动态效果设计与运用的步骤如下：

1.确定需求：确定网站动态效果的类型和范围，根据网站主题和用户需求进行选择。

2.选择工具：选择适合的工具，如JavaScript、jQuery、CSS3等等。

3.设计效果：根据需求和工具的特点进行设计，包括动画效果、交互效果、特效等等。

4.测试效果：在不同的浏览器和设备上进行测试，确保效果的兼容性和稳定性。

5.应用效果：将设计好的效果应用到网站中，保证效果与网站的整体风格和设计相符合。

6.优化效果：根据用户反馈和数据分析，对效果进行调整和优化，提升用户体验和网站性能。

在网站定制中，网站动态效果的设计和运用可以增强网站的交互性和美观度，提高用户体验和留存率。但需要注意，过多或不合适的动态效果会影响网站的性能和加载速度，因此需要结合实际情况进行设计和运用。